ZEN是所有蔡司成像系统通用的用户界面。无论是简单工作还是常规工作,ZEN都会引导您直接获得结果。对于复杂的研究实验,ZEN可按照您所需的方式灵活设计多维工作流。直观的工具和模块助您完成任意显微任务:
使用经过科学验证的算法处理图像
通过GPU驱动的三维引擎对大数据进行可视化
通过基于机器学习的工具分析图像
关联光学和电子显微镜
智能采集
让棘手的实验成功进行可使用统一的便捷界面操作您的每台设备。无论是何种显微镜类型,智能设置——即智能控制中心均可自动为您生成设置。若您希望进行重复性的实验?只需打开之前采集的原始图像,一键调用,即可精准复制相应的实验设置。还有更多智能的自动化功能待您探索:包括可引导您检测罕见事件、帮助您硬件校准等。
定量处理
获得可靠且可重复的结果180多种图像处理工具助您转换和管理数据。只要搜索您所需方法的关键词,如记波器或去卷积,ZEN便会直接引导您至相应位置。ZEN将读取输入图像的元数据,然后仅显示逻辑处理步骤,并自动优化默认参数。您甚至可以使用第三方导入工具处理其他平台的图像。通过专门的操作界面,还可轻松批量处理多幅图像,获得定量和无偏差的结果。
强大的可视化功能
与您的大数据自如互动您可在高放大倍率下快速生成大型多通道二维拼图,并像使用地图应用程序一样,轻松通过鼠标滚动顺滑地放大和缩小。有200 GB经透明化处理的小鼠大脑数据?只需将其载入ZEN,多种三维渲染方法的速度和清晰度将为您带来惊喜。借助arivis ImageCore技术并高效利用系统资源,您甚至可以在普通消费级硬件上查看大型三维图像。
轻松实现分析
有效地深入了解您的研究通过数字分割和对齐工具进行图像分析对于从显微镜图像中提取有意义的信息至关重要。ZEN使用简单的模块化工具Bio应用程序处理这项任务。每一个Bio应用程序都对一种类型的应用进行了优化(如细胞计数或细胞融合度测量),具有量身定制的分割设置和简化的数据展示。ZEN中基于向导式的Image Analysis模块会逐步指导您创建个性化测量。
极具特色的关联显微镜
将跨尺度和不同成像模式的视图相结合ZEN可以将您的多模态数据进行叠加、导航、组织管理。您无需再花费数天时间,艰难地定位两个特殊神经元之间的突触以获得超微结构信息。宽场荧光显微镜的大视野与场发射电子显微镜的高分辨率相结合,可显著提高您的效率。ZEN让您可以通过荧光标记快速概览整个切片,识别并重新定位用于电镜成像的感兴趣区域。
安全的存储
处理复杂数据不在话下ZEN存储所有有价值的实验及其元数据。
.czi是Bio-Formats兼容的文件格式,可通过ImageJ和众多其他第三方软件直接读取。您还可将数据导出至OME-TIFF(Open Microscopy Environment,开放显微成像软件),进一步促进跨平台图像数据的转换。
为管理海量数据,ZEN提供了一个基于服务器的中央平台,用于存储和组织您的原始数据并管理用户访问权限。此外,您还可以通过ZEN Data Explorer,随时随地从浏览器进行访问。
ZEN工具包结构
优化的访问,无限的可能
ZEN软件为所有显微镜用户提供了一个全面的端到端解决方案,它不断进化以满足生命科学领域不断涌现的新需求。例如,它新增了自动智能采集、直观的图像分析和基于云的数据管理等功能。然而,增加的功能也使ZEN生态系统更加复杂。使用ZEN工具包结构,选项更为精简,众多功能唾手可得。您可以根据自己的实验需求,选择性地安装包含采集、分析和特定高级功能的工具包,从而量身定制自己的ZEN软件环境。
采集工具包
基础版
使用手动、编码和电动显微镜进行多通道荧光和时间序列实验的基本图像采集。
电动聚焦版
获取多通道荧光、时间序列和Z轴序列实验图像,并具有软件自动聚焦及景深扩展处理和同步数据处理功能。电动版
获取多通道荧光、时间序列、Z轴序列、拼图扫描和多点位实验图像,并具有软件自动聚焦及景深扩展处理和同步数据处理功能。高级版
获取多通道荧光、时间序列、Z轴序列、拼图扫描、多点扫描和高动态范围的共聚焦实验图像,并具有软件自动聚焦及景深扩展处理、同步数据处理和共定位分析功能。智能版
使用简单的用户界面设置不同类型的采集实验,并使用图像分析或Python脚本工具进行自适应自动图像采集。
2 . 分析和可视化工具包
2D
使用扩展的图像处理功能,利用直观的软件向导程序指导进行自动2D图像分析。
3D
使用扩展图像处理功能,借助高级渲染工具显示3D/4D序列图像,利用直观的软件向导程序指导进行自动3D图像分析。
AI
基于深度学习算法对图像进行分割、分类和降噪,可通过专门用于AI模型训练的用户界面访问。
关联
使用以样品为中心的操作界面和专用文件管理系统,获取并关联不同设备(如光学和电子显微镜)的图像。
开发者
使用专门的Python脚本编辑器进行记录、调试和代码补全,以自定义和自动化进行图像采集、处理和分析。
分子定量
在使用成熟算法的专用分析操作界面中,使用荧光漂白后恢复、荧光共振能量转移和比率成像进行分子动力学采集和分析。
去卷积
由高效多CPU/多GPU处理器提供支持,使用15种已发布的去卷积算法,将2D和3D数据分辨率直观地增强至120 nm。
Bio Applications
通过基于AI的分割和定制结果的展示,实现开箱即用的细胞计数、融合度测量、点检测和基因/蛋白质表达的功能。
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